2002年10月市妇幼保健院、市妇幼保健所与二院兼并，建立苏州市母亲和孩子医疗健康保障中心并附设苏州市生殖健康中心、姑苏市计划生育指导中心。2005年，医院与市三院、四院合并组建姑苏市立医院，为市立医院本部。该医院是产科、妇科、生殖遗传中心、超声科、骨科、新生儿科、心血管内科、影像科、检验科为省、市级别的要点专科。母子医疗保健中心集产科、新生儿科、儿科、生殖遗传中心、妇保科、儿童保健科于一体，为孕妇和儿童提供全方位的服务。

产科引进了先进的家庭化产科服务模式，拥有华东地区规模最大的，集产妇等待分娩、分勉、恢复于一体的LDR产房，医生护士陪同整个分娩过程。新生儿科拥有国内最先进的新生儿监护病房。生殖与遗传中心配备有国内领先的超净化胚胎实验室、遗传诊断实验室和IVF工作站，以遗传性疾病诊断、辅助生殖、不孕不育症治疗为主，是姑苏市产前诊断和新生儿遗传疾病筛查中心，并开展了第三代试管婴儿技术。

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